Ist beides ungefähr das selbe nur das XEN ausgereifter ist und Läuft zudem auf fast jeder aktuellen Hardware, auch ohne Virtualisierungsfeatures!
KVM ist einfacher zu installieren als XEN.
Xen bietet mehr Drittanbietertools als KVM und Xen ist von der CPU Auslastung her stabiler als KVM wobei KVM bei Festplattengeschwindigkeit besser ist.
Sind halt die Kleinigkeiten.
Ich weiß zwar nicht wo du das mit dem "KVM ist bei der Festplattengeschwindigkeit besser" hast, aber gut (vlt. mit Caching / RAM-Boosting dann ja).
Auf Xen zu setzen ist gut es ist zwar älter, jedoch sicherer und greift direkt auf die Hardware zu (Ring0) was eine bessere Performance bietet - auf dem Papier.

Nachteil - es wird nicht wirklich weiterentwickelt und läuft neben dem Kernel der Hostmaschine - KVM/Qemu läuft auf dem Kernel.
Server-Verleih setzt seit Anfang an auf KVM/Qemu, inzwischen seit 4 Jahren ohne größere Probleme (KVM Jailbreak usw.) auch in der v3 setzen wir auf KVM.
Im Endeffekt fällt das nicht groß auf welche Technik du setzt, kann dir persönlich KVM empfehlen aber auch nur weil ich Xen nicht ausgetestet habe.